MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 chromosome

Total Repeats: 85934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017190	T	6	6	3	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017190	T	6	6	14	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017190	ACA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017190	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017190	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017190	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017190	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017190	GT	3	6	316	321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017190	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017190	AAAAG	2	10	385	394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017190	AT	3	6	419	424	50 %	50 %	0 %	0 %	384162405
12	NC_017190	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
13	NC_017190	CTGG	2	8	567	574	0 %	25 %	50 %	25 %	384162405
14	NC_017190	AT	3	6	607	612	50 %	50 %	0 %	0 %	384162405
15	NC_017190	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162405
16	NC_017190	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162405
17	NC_017190	A	6	6	697	702	100 %	0 %	0 %	0 %	384162405
18	NC_017190	ATCGG	2	10	775	784	20 %	20 %	40 %	20 %	384162405
19	NC_017190	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
20	NC_017190	TTTA	3	12	849	860	25 %	75 %	0 %	0 %	384162405
21	NC_017190	G	7	7	862	868	0 %	0 %	100 %	0 %	384162405
22	NC_017190	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384162405
23	NC_017190	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162405
24	NC_017190	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162405
25	NC_017190	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162405
26	NC_017190	AACA	2	8	1079	1086	75 %	0 %	0 %	25 %	384162405
27	NC_017190	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162405
28	NC_017190	CAAA	2	8	1131	1138	75 %	0 %	0 %	25 %	384162405
29	NC_017190	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162405
30	NC_017190	GAAA	2	8	1268	1275	75 %	0 %	25 %	0 %	384162405
31	NC_017190	GTT	2	6	1375	1380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162405
32	NC_017190	GCT	2	6	1423	1428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162405
33	NC_017190	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162405
34	NC_017190	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
35	NC_017190	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162405
36	NC_017190	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162405
37	NC_017190	GA	3	6	1644	1649	50 %	0 %	50 %	0 %	384162405
38	NC_017190	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162405
39	NC_017190	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162405
40	NC_017190	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
41	NC_017190	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
42	NC_017190	GAAA	2	8	1725	1732	75 %	0 %	25 %	0 %	384162405
43	NC_017190	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162405
44	NC_017190	CTA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017190	TAC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017190	T	6	6	1894	1899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017190	AT	3	6	1903	1908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017190	ATTAT	2	10	1911	1920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017190	AGG	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017190	AAC	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162406
51	NC_017190	TCAT	2	8	2100	2107	25 %	50 %	0 %	25 %	384162406
52	NC_017190	AGA	3	9	2114	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162406
53	NC_017190	CGAT	2	8	2140	2147	25 %	25 %	25 %	25 %	384162406
54	NC_017190	TGC	2	6	2164	2169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162406
55	NC_017190	TTC	2	6	2178	2183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162406
56	NC_017190	A	6	6	2196	2201	100 %	0 %	0 %	0 %	384162406
57	NC_017190	AATTT	2	10	2272	2281	40 %	60 %	0 %	0 %	384162406
58	NC_017190	CAT	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162406
59	NC_017190	ATT	2	6	2456	2461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162406
60	NC_017190	CGT	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162406
61	NC_017190	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162406
62	NC_017190	TTA	2	6	2611	2616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162406
63	NC_017190	TTC	2	6	2655	2660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162406
64	NC_017190	GCT	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162406
65	NC_017190	TCG	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162406
66	NC_017190	CTT	2	6	2770	2775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162406
67	NC_017190	GA	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	384162406
68	NC_017190	CAA	2	6	2795	2800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162406
69	NC_017190	TCA	2	6	2844	2849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162406
70	NC_017190	AGT	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162406
71	NC_017190	GCTG	2	8	2885	2892	0 %	25 %	50 %	25 %	384162406
72	NC_017190	TTCA	2	8	2921	2928	25 %	50 %	0 %	25 %	384162406
73	NC_017190	AT	3	6	2936	2941	50 %	50 %	0 %	0 %	384162406
74	NC_017190	ATG	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162406
75	NC_017190	AAAC	2	8	3073	3080	75 %	0 %	0 %	25 %	384162406
76	NC_017190	TGC	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017190	TCA	2	6	3119	3124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017190	CAAG	2	8	3135	3142	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017190	T	6	6	3166	3171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017190	CGG	2	6	3291	3296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162407
81	NC_017190	GAGC	2	8	3315	3322	25 %	0 %	50 %	25 %	384162407
82	NC_017190	CAA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162407
83	NC_017190	CGC	2	6	3355	3360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162407
84	NC_017190	GTC	2	6	3418	3423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162407
85	NC_017190	GC	3	6	3489	3494	0 %	0 %	50 %	50 %	384162408
86	NC_017190	ATC	2	6	3526	3531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162408
87	NC_017190	CGCAC	2	10	3596	3605	20 %	0 %	20 %	60 %	384162408
88	NC_017190	GAAG	2	8	3655	3662	50 %	0 %	50 %	0 %	384162408
89	NC_017190	TGA	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162408
90	NC_017190	A	6	6	3709	3714	100 %	0 %	0 %	0 %	384162408
91	NC_017190	AGC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162408
92	NC_017190	TCAG	2	8	3755	3762	25 %	25 %	25 %	25 %	384162408
93	NC_017190	GAG	3	9	3834	3842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162408
94	NC_017190	A	6	6	3905	3910	100 %	0 %	0 %	0 %	384162408
95	NC_017190	AGC	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162408
96	NC_017190	AAAAGA	2	12	4197	4208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384162408
97	NC_017190	ATT	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162408
98	NC_017190	GAT	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162408
99	NC_017190	T	6	6	4256	4261	0 %	100 %	0 %	0 %	384162408
100	NC_017190	CAG	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162408
101	NC_017190	ACG	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162408
102	NC_017190	GAA	2	6	4357	4362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162408
103	NC_017190	GAT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162408
104	NC_017190	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162408
105	NC_017190	CAC	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384162408
106	NC_017190	AGTGA	2	10	4548	4557	40 %	20 %	40 %	0 %	384162408
107	NC_017190	GAC	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162409
108	NC_017190	TCG	2	6	4621	4626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162409
109	NC_017190	GAA	2	6	4665	4670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162409
110	NC_017190	GACA	2	8	4677	4684	50 %	0 %	25 %	25 %	384162409
111	NC_017190	GAAA	2	8	4685	4692	75 %	0 %	25 %	0 %	384162409
112	NC_017190	AGT	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162409
113	NC_017190	CCGT	2	8	4701	4708	0 %	25 %	25 %	50 %	384162409
114	NC_017190	AT	4	8	4747	4754	50 %	50 %	0 %	0 %	384162409
115	NC_017190	GAA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162409
116	NC_017190	AT	3	6	4837	4842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017190	CAG	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162410
118	NC_017190	ATG	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162410
119	NC_017190	TCG	2	6	5010	5015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162410
120	NC_017190	ACA	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162410
121	NC_017190	CGGT	2	8	5118	5125	0 %	25 %	50 %	25 %	384162410
122	NC_017190	TCA	2	6	5160	5165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162410
123	NC_017190	TTC	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
124	NC_017190	CGG	2	6	5218	5223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162410
125	NC_017190	AAC	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162410
126	NC_017190	TCAT	2	8	5592	5599	25 %	50 %	0 %	25 %	384162410
127	NC_017190	TTGCA	2	10	5649	5658	20 %	40 %	20 %	20 %	384162410
128	NC_017190	GGC	2	6	5720	5725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162410
129	NC_017190	AAG	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162410
130	NC_017190	TGA	2	6	5824	5829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162410
131	NC_017190	GA	3	6	5833	5838	50 %	0 %	50 %	0 %	384162410
132	NC_017190	CAT	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162410
133	NC_017190	TTC	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
134	NC_017190	CTT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
135	NC_017190	GGC	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162410
136	NC_017190	A	6	6	6044	6049	100 %	0 %	0 %	0 %	384162410
137	NC_017190	TTC	2	6	6118	6123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
138	NC_017190	GCGG	2	8	6170	6177	0 %	0 %	75 %	25 %	384162410
139	NC_017190	GGGAC	2	10	6190	6199	20 %	0 %	60 %	20 %	384162410
140	NC_017190	TC	3	6	6271	6276	0 %	50 %	0 %	50 %	384162410
141	NC_017190	TTA	2	6	6413	6418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162410
142	NC_017190	TTC	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
143	NC_017190	ATT	2	6	6446	6451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162410
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149	NC_017190	GCT	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017190	CTA	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017190	ATT	2	6	6975	6980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017190	T	7	7	7002	7008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017190	AC	3	6	7023	7028	50 %	0 %	0 %	50 %	384162411
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156	NC_017190	AATG	2	8	7165	7172	50 %	25 %	25 %	0 %	384162411
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161	NC_017190	TTCGG	2	10	7337	7346	0 %	40 %	40 %	20 %	384162411
162	NC_017190	TCC	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384162411
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267	NC_017190	GAG	2	6	13336	13341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_017190	GA	3	6	13438	13443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017190	CGG	2	6	13596	13601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_017190	GA	3	6	13694	13699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
272	NC_017190	TAGG	2	8	13812	13819	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017190	TAC	2	6	13866	13871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_017190	CGC	2	6	13896	13901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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277	NC_017190	GGT	2	6	14090	14095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017190	CGT	2	6	14285	14290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_017190	GAG	2	6	14334	14339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017190	GTT	2	6	14388	14393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_017190	C	6	6	14461	14466	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
282	NC_017190	GAT	2	6	14512	14517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017190	ATCG	2	8	14573	14580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
284	NC_017190	GA	3	6	14626	14631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017190	TGG	2	6	14647	14652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
286	NC_017190	CGC	2	6	14750	14755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_017190	TCA	2	6	14782	14787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_017190	T	6	6	14797	14802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017190	GTA	2	6	14837	14842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162412
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403	NC_017190	GTG	2	6	20630	20635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
404	NC_017190	T	6	6	20803	20808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_017190	GTT	2	6	20832	20837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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